圣水主要用于升级军队、法术和部分建筑，也能升级部分城墙；它不是训练部队的日常消耗品。主世界的部队、法术和攻城机器训练已取消资源费用，因此打仗不会像旧版本那样持续扣圣水。圣水满仓时，优先把它投向实验室研究、关键进攻建筑或可用圣水升级的城墙，别为了消耗资源盲目升本。
实验室研究是圣水最值得优先安排的用途之一，尤其适合经常使用固定流派的玩家。打开实验室查看兵种与法术的升级费用、时间和解锁条件，先升主力部队、常用法术，再考虑偶尔才用的单位；研究期间实验室不能同时进行第二项研究，所以按当前常用阵容选择，不要只看升级后等级更高。不同大本营阶段可研究的项目与费用不同，具体以游戏内显示为准。
升级进攻建筑能提升后续作战能力，常见圣水用途包括兵营、训练营、法术工厂、实验室、部落城堡和兵营容量相关建筑；具体建筑及费用随大本营进度变化。新阶段可先查看这些建筑是否解锁新兵种、法术、攻城机器或更多部队容量，再安排工人；若升级会暂时影响训练或作战功能，避开部落战、联赛等需要出战的时段。部落城堡升级也可能消耗圣水，捐兵时则按游戏内捐赠界面确认所需资源。
圣水还可用于升级部分英雄和城墙，但并非所有英雄、城墙等级都能用圣水支付。大本营11级及以上可解锁的弓箭女皇以外，圣水升级英雄中最关键的是大守护者；查看英雄升级界面确认费用与条件，持续升级能强化其等级和战斗能力。城墙升级若出现金币与圣水两种付款选项，可优先用更充裕的一种，把另一种留给当前必须进行的建筑或研究；若选项未显示，就不能用圣水支付。
不同阶段的花费顺序应随缺口调整：低本先保证关键进攻建筑和主力研究，高本则把圣水安排给大守护者、实验室项目及可用圣水支付的城墙。圣水不足时，可升级圣水收集器并通过多人对战掠夺资源；收集器容量有限，记得及时领取，攻击时优先找圣水收集器和储存罐中资源较多的村庄。圣水符石可直接填满家乡村庄圣水储存罐，但储存罐已满时不能使用，最好先花掉一部分再开符石。
