获取深海蘖蕖萃取物最直接的方式是完成游戏内的警报任务。在飞船的导航界面右上角，找到带有感叹号标识的警报任务区域，每日会多次刷新不同奖励的警报任务，当奖励列表中显示包含深海蘖蕖萃取物时，直接点击并完成任务即可在结算时获得一个该资源，如果对应任务节点未解锁，则需要先完成地图开启条件。
另一个稳定的获取渠道是通过午夜电波活动兑换。玩家可以积攒午夜电波任务中获得的15个特殊货币，前往贡品商店直接购买5个深海蘖蕖萃取物，这种方法不受任务刷新限制，适合作为长期稳定的补充来源。部分常规任务也有几率产出深海蘖蕖萃取物，但概率相对较低。这些任务包括核心破坏、Orokin破坏以及月球或赤毒要塞的歼灭任务，玩家可以从这些任务地图中的储藏舱内低几率发现该资源。
参与尸鬼净化赏金活动也是途径之一。完成该活动系列任务后，玩家有机会从部分轮次的奖励池中获得深海蘖蕖萃取物。在Archwing相关模式中也能尝试获取。特别是在海王星和天王星（如Ophelia节点）的Archwing或水下战斗任务中，击败敌人或完成目标时有几率掉落深海萃取物，即国服所称的蘖蕖深海萃取物，进行这类任务前建议做好相应的装备准备。
