击败肉山后，你的世界将发生不可逆转的转变，永久进入更具挑战性的困难模式。这是游戏进程的一个重要分水岭，意味着你将面对更强大的敌人，同时也能探索更丰富的内容和获取更高级的资源。此阶段的核心任务首先是利用肉山掉落的神圣之锤，去摧毁散布在地图中的恶魔祭坛或猩红祭坛。每次摧毁祭坛都会在世界中生成新的矿物，为后续的装备升级奠定基础。
敲碎祭坛后，地底洞穴层会生成三个等级的新矿石，分别是钴蓝矿或钯金矿、秘银矿或山铜矿，以及精金矿或钛金矿，每次敲击祭坛会随机从两组中选择一种矿石解锁。你的首要目标是尽快采集第一等级的钴蓝矿或钯金矿，并优先制作一把对应的钻头，这将极大提升你后续的采矿与探索效率。采集到足够矿石，应在熔炉和铁砧处将其锻造成锭，并逐步制作整套新防具，以应对陡然增强的怪物威胁。
你需要密切关注世界的变化。困难模式开启后，神圣之地与腐化之地或猩红之地会开始加速蔓延，它们可能会侵蚀你的建筑与生态环境，因此考虑使用隔离带或特定的道具来控制其扩散范围是必要的。在洞穴层的神圣与邪恶生物群落中，现在会分别掉落光明之魂与黑暗之魂，这些是合成许多强力武器和召唤物的关键材料，应有计划地进行收集。敌人的强度全面提升，在冰雪环境等特定区域会出现新的强大敌怪，击败它们可以获得用于制作进阶装备的材料。
当你的装备提升到一定程度后，便可以着手挑战困难模式的中期核心敌人——机械三王，它们分别是毁灭者、双子魔眼和机械骷髅王。建议的挑战顺序通常是从毁灭者开始，然后是双子魔眼，最后是机械骷髅王。击败全部机械三王后，丛林地下会开始生成世纪之花的花苞，破坏它即可召唤并挑战世纪之花。成功击败世纪之花将掉落神庙钥匙，允许你进入丛林神庙挑战石巨人BOSS，并获取如日耀碑牌等更高级的装备部件，从而为后续的终局挑战做好准备。
