在饥荒海难中有着中毒的机制，让玩家的生存更加困难，与主世界不同海难dlc则是有着更多样的玩法，而中毒作为一种负面效果也是有着很多因素造成的。当玩家被毒蛇或者毒蚊子毒蜘蛛所撕咬，是会受到物理攻击的中毒，而松鼠鱼或者毒洞都是会发出气体来让角色中毒，前者可以通过贝壳甲或者牛角帽这类装备很好的避免，而如果遇到了气体毒气则是需要来带上防毒面具，才能够让角色不受毒气的影响。
中毒所受的伤害并不是像持续掉血那样一直固定的伤害，它会随着时间的增长而产生一定的变化，时间越久在伤害和掉血速度上都是会更高的，同时精神值也会受到持续降低。除了玩家之外游戏中的一些生物也是会受到毒气的影响，在中毒后普通生物则是会得到移速降低以及攻速降低，当生物死于中毒时，掉落的物品则是会直接因此损失大量的新鲜值，毒性效果在生物身上是会在两分钟之后才消失，而对于鹈鹕这类生物，自己能解毒的机制相当于完全免疫，而对于毒性生物只有蜘蛛战士会被毒杀死。
解决中毒的方法则是要使用血清，在制造栏中只需要有着一本科技就可以解锁原型，所需要的材料也是比较容易的，一定数量的海带和珊瑚最后读线则是比较关键的材料。当然玩家也可以直接通过读线来进行解毒，但这样的方式会让角色直接受到一定的血量减少，如果玩家当前血量本来就不多的时候，毒腺也不会完全致命，至少会给角色留到5点生命值得以存活，利用这个机制，如果角色血量本来就不多的时候，直接毒腺治疗是更省材料的方式。
